ההבדל העיקרי הוא ההבדל בחומר הפעיל. החומר הפעיל של הסוללה המשנית הוא הפיך, בעוד החומר הפעיל של הסוללה הראשית אינו הפיך. הפריקה העצמית של הסוללה הראשית קטנה בהרבה מזו של הסוללה המשנית, אך ההתנגדות הפנימית גדולה בהרבה מזו של הסוללה המשנית, ולכן קיבולת העומס נמוכה יותר.
בנוסף, הקיבולת הספציפית למסה והקיבולת הספציפית לנפח של הסוללה הראשית גדולים יותר מאשר סוללות נטענות כלליות.
